La Escuela Nacional de Comercio – Nivel Medio fue fundada el 20 de abril de 1953 como instituto adscripto a la Escuela de Comercio de Río Cuarto, para capacitar alumnos en contabilidad ante la creciente demanda por el auge industrial y comercial.

Oficializada en 1958, funcionó en una Escuela primaria, y en 1965 creó la Cooperativa Estudiantil con personería jurídica que, ante el crecimiento de la institución impulsó la búsqueda de un edificio propio, logrando que en 1969 pueda trasladarse al inmueble adquirido por la Cooperativa Estudiantil “Charles Howarth” en Avda. San Martín 547.

En 1988 se creó el Nivel Terciario con las carreras de Analista de Sistemas, Técnico Superior en Administración de Empresas y Técnico Superior en Cooperativismo y Mutualismo, reconocidas por el Ministerio de Educación de la Nación. La matrícula fue numerosa, demandando especialmente en áreas de Informática, Administración y cooperativismo.

En la década del 80, el Gobierno Provincial inició la construcción de un nuevo edificio, compartido con el Colegio Nacional José Hernández, al que se trasladaron en 1991, para el que la comunidad educativa colaboró activamente para su finalización.
La Ley Federal de Educación de 1995 transfirió la escuela a la administración provincial, denominándose Escuela Superior de Comercio. Desde 2007, depende de la Dirección General de Educación Técnica y Formación Profesional.

En 2015, el Nivel Secundario se desanexó, constituyéndose el IPEM Nº 394, quedando la Escuela Superior de Comercio dictando carreras de Nivel Técnico Superior.
Atendiendo a las características de la población estudiantil, desde el año 2018, se implementaron aulas virtuales para el dictado de clases desde la modalidad, virtual y presencial, para garantizar la continuidad educativa a estudiantes que estudian y trabajan.

El 12 de septiembre de 2024 se firma el Convenio de Transferencia de la Escuela Superior de Comercio a la Universidad de la Provincia de Córdoba, constituyéndose una unidad de organización académica administrativa que afiance la regionalización y en la cual se alojen las diferentes propuestas educativas que se ofrecerán a la comunidad.
Sobre la base de la Escuela Superior de Comercio se constituye la Sede Regional Río Tercero como nueva unidad de organización académico administrativa.

Desde la Secretaría Académica se coordinó la participación de comisiones docentes que trabajaron en la actualización de la propuesta académica de la Sede Río Tercero.